1208 | |
发表时间:2017-08-25 阅读次数:314 | |
直接测序法(SNP法)(编号:1208) 一、服务介绍 SNP,即单核苷酸多态性(Single Nuleotide Polymorphism),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。通常情况下是一种二等位基因的变异,多为转换,即一种嘧啶碱基换成另一种嘧啶碱基,或一种嘌呤碱基换成另一种嘌呤碱基。SNP在CG序列上出现最为频繁,而且多是C→T,因为CG中C即胞嘧啶常被甲基化,自发脱氨后即变成胸腺嘧啶。 直接测序法是SNP检测方法中最准确的方法,它是将待检测片段进行PCR扩增后并直接测序。纯合位点为单峰,而杂合位点为套峰,因而很容易将几种基因型区分开来。直接测序法不仅可用于对已知位点的检测,还可用于发现未知的SNP位点。通过直接测序方法进行SNP检测的检出率接近100%。 二、实验内容 1. 样本DNA提取 2.引物设计、合成 4. 测序,分析结果 三、客户提供 1.SNP位点信息:人类基因组还需SNP位点的rs号。其他物种如牛、鸡、鱼等无rs号的需要SNP位点上下游各200bp的确切序列 2. SNP位点的突变类型,以及位点的上下游25bp内是否存在其他位点。 四、公司提供 1. 原始SNP峰型图 2. SNPs结果 3. 实验报告(实验步骤,引物序列,扩增体系)
|
|